Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms