Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC1Q13547 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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