Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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