Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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