Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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