Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
REG3AQ06141 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
REG3AQ06141 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms