Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms