Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC093159.2-201ENST00000603429 636 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-210ENST00000610565 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-211ENST00000613173 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-213ENST00000617405 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-218ENST00000620576 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCL4L2-219ENST00000620732 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms