Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms