Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms