Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms