Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms