Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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