Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms