Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNTAP49354 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms