Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD8P48556 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD8P48556 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms