Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5OP48047 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms