Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGCXP38435 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GGCXP38435 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GGCXP38435 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms