Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFC1P35251 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFC1P35251 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms