Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCR1P32246 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCR1P32246 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCR1P32246 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms