Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms