Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO2P25791 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms