Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALB2P22676 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms