Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF1P22415 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF1P22415 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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