Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms