Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNNI3P19429 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms