Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms