Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CTRB1P17538 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CTRB1P17538 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTRB1P17538 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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