Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT3P12035 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT3P12035 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT3P12035 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms