Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms