Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC24AO95486 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms