Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms