Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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