Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms