Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms