Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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