Protein–RNA interactions for Protein: A6NEE1

PLEKHD1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHD1A6NEE1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLEKHD1A6NEE1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms