Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms