Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms