Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms