Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC7AQ9ULT0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms