Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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