Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms