Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms