Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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