Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms