Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms