Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPJQ9HC77 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms