Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms