Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf27Q9GZN8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms